Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms