Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms