Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms