Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMC1P11047 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms