Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI2P10070 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI2P10070 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms