Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms