Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms