Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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