Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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