Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG7O95352 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG7O95352 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms