Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms