Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NBNO60934 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NBNO60934 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NBNO60934 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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