Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXC11O43248 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HOXC11O43248 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HOXC11O43248 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC11O43248 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC11O43248 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC11O43248 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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