Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP290O15078 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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