Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6BO15054 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms