Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms