Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms