Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA8SH3BPF8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms