Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E9PBE3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms