Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms