Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms