Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms