Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms