Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms