Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms