Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HPS5Q9UPZ3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms