Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms