Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms