Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms