Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms