Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCC13Q9NSE7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms