Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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