Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE2TQ9NPD8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2TQ9NPD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms