Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MID1IP1Q9NPA3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms