Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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