Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms