Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms