Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms