Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms