Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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