Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms