Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms