Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E3Q969T4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms