Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 581.9 ms