Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms