Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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