Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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