Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPA2Q8IWL1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPA2Q8IWL1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms