Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS1Q86UR5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS1Q86UR5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms