Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms